// 仮に↓のコメント化を外してこの文字が表示されたら取れてないので別途処理が必要
// echo 'カスタム投稿だよ';

の部分を

$strtitle = the_title('','', FALSE) ;
// 記事タイトルが未記入な場合はidを表示させる
if ( !isset($strtitle) || $strtitle == "" ) {
	$strtitle = $post->ID;
}
echo $strtitle;

と変更すればタイトル部分のみの表示になると思います。

もしカスタム分類（独自に作ったカテゴリーやタグみたいなもの）まで
含めたパン屑にしようとすると、ちょっと自信が無いのですが、

$taxonomy_name = 'タクソノミー名';
$termsids = get_the_terms( $post->ID, $taxonomy_name );
if ( count($termsids) ) {
	foreach ( $termsids as $term ) {
		if ( $homeviewflag ) {
			echo $separator;
		} else {
			$homeviewflag = true;
		}
		$str_term = get_term_link( $term->slug, $taxonomy_name );
		if ( is_wp_error( $str_term ) ) {
			$str_term = '';
		}
		?>
		<a href="<?php echo $str_term; ?>" title="<?php echo esc_attr( sprintf( __( "View all posts in %s" ), $term->name ) ); ?>">
			<?php echo esc_html($term->name); ?>
		</a>
		<?php
	}

	if ( $homeviewflag ) {
		echo $separator;
	} else {
		$homeviewflag = true;
	}

	$strtitle = the_title('','', FALSE) ;
	// 記事タイトルが未記入な場合はidを表示させる
	if ( !isset($strtitle) || $strtitle == "" ) {
		$strtitle = $post->ID;
	}
	echo $strtitle;
}

・・・こういう感じ・・・かな？？？
（なんか、もっとうまい方法がある気もします＾＾；）

一行目の「$taxonomy_name = ‘タクソノミー名’」という行の
「タクソノミー名」はリンダさんが設定されたタクソノミー名
（register_taxonomy関数で追加された分類名称）
と同じにしてください。

記事の77行目から88行目の部分の

 $tempcatids = get_the_category();
 $tempcatid = $tempcatids[0];
 if ( $homeviewflag ) {
     echo $separator;
 }
echo get_category_parents( $tempcatid->cat_ID, TRUE, $separator );
$strtitle = the_title('','', FALSE) ;
// 記事タイトルが未記入な場合はidを表示させる
if ( !isset($strtitle) || $strtitle == "" ) {
    $strtitle = $post->ID;
}
echo $strtitle

という記述を

$tempcatids = get_the_category();
if ( count($tempcatids) ) {
	$tempcatid = $tempcatids[0];
	if ( $homeviewflag ) {
		echo $separator;
	}
	echo get_category_parents( $tempcatid->cat_ID, TRUE, $separator );
	$strtitle = the_title('','', FALSE) ;
	// 記事タイトルが未記入な場合はidを表示させる
	if ( !isset($strtitle) || $strtitle == "" ) {
		$strtitle = $post->ID;
	}
	echo $strtitle;
} else {
	// 仮に↓のコメント化を外してこの文字が表示されたら取れてないので別途処理が必要
	// echo 'カスタム投稿だよ';
}

に差し替えてみてください。

すすみません！
ドコからドコまでと差し替えればよいのでしょうか？

初心者ですみません！！

えっと、カスタム投稿タイプの場合、
もしかしたらシングル部分の処理が（is_single()）
get_the_category関数が取得できないかもしれません。
（ごめんなさい。実際に動かしてはいないので的外れかもしれませんが）
・・・以下のように変えたらどうでしょ？

$tempcatids = get_the_category();
if ( count($tempcatids) ) {
	$tempcatid = $tempcatids[0];
	if ( $homeviewflag ) {
		echo $separator;
	}
	echo get_category_parents( $tempcatid->cat_ID, TRUE, $separator );
	$strtitle = the_title('','', FALSE) ;
	// 記事タイトルが未記入な場合はidを表示させる
	if ( !isset($strtitle) || $strtitle == "" ) {
		$strtitle = $post->ID;
	}
	echo $strtitle;
} else {
	// 仮に↓のコメント化を外してこの文字が表示されたら取れてないので別途処理が必要
	// echo 'カスタム投稿だよ';
}

どうしたらよいかわからないので、教えていただきたいのですが、
カスタム投稿タイプの場合のパンくずに「Object id #3622」とかつくのですが
これを削除するにはどうしたらよいのでしょうか？

よろしくお願いいたします。

改行テストとして上げてみる。
ここでｂｒも